Jean-Frédéric Jauslin est né en 1954 au Locle (canton de Neuchâtel). Il a étudié les mathématiques et l'informatique à l'Université de Neuchâtel. Après avoir obtenu un doctorat en informatique à l'ETH de Zurich, il a  travaillé dans l'économie privée, en tant que responsable de la division informatique d'une société d'assurances.

En 1990, il devient directeur de la Bibliothèque nationale suisse. Il opère une réorganisation fondamentale des processus d'exploitation, de l'informatique, et de la conservation et protection des fonds de la Bibliothèque. Il améliore également la coordination avec les autres bibliothèques et institutions spécialisées au niveau national et international. En 2002, il devient président de la «Conference of European National Librarians CENL» qui réunit les directrices et directeurs de plus de quarante bibliothèques nationales européennes. Entre 1995 et 2005 il préside l'association MEMORIAV, qui vise à la conservation des biens culturels audiovisuels.

Jean-Frédéric Jauslin est directeur de l'Office fédéral de la culture depuis le 1er avril 2005.

Sous sa direction a été préparée la Loi sur l'encouragement de la culture de la Confédération, qui instaure pour la première fois une politique de soutien coordonnée de la Confédération en matière culturelle. Il a conduit les changements dans la gestion des musées de la Confédération, le Musée national suisse se voyant doté d'un statut juridique indépendant. Avec pour credo la promotion de la diversité culturelle et le soutien aux minorités, l'Office fédéral de la culture a mené une politique de sauvegarde des langues nationales, qui a été validée par l'adoption par le Parlement d'une loi fédérale sur les langues. Dans le domaine du cinéma et des arts visuels l'Office a développé sous la houlette de Jean-Frédéric Jauslin une politique de promotion active, qui repose notamment sur des prix nationaux conçus pour accroître la reconnaissance et la visibilité des créateurs sur le plan national. Dans le domaine de la préservation du patrimoine, la Suisse a vécu sous la direction de Jean-Frédéric Jauslin quatre nouvelles inscriptions de sites au Patrimoine mondial de l'UNESCO, le Lavaux, les chemins de fer rhétiques, la Chaux-de-fonds - Le Locle et les Palaffites, une candidature transnationale sérielle menée par la Suisse en collaboration avec 5 pays alpins du centre de l'Europe.